Protein–RNA interactions for Protein: P29595

Nedd8, NEDD8, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd8P29595 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms