Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms