Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18525 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18525 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P18525 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18525 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18525 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18525 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P18525 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18525 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18525 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18525 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18525 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18525 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P18525 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P18525 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18525 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18525 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18525 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18525 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18525 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18525 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18525 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18525 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18525 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18525 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18525 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P18525 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18525 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18525 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P18525 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P18525 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18525 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18525 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18525 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18525 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18525 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18525 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18525 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18525 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18525 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18525 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18525 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P18525 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18525 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18525 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18525 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18525 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18525 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18525 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18525 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18525 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18525 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18525 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18525 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18525 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18525 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18525 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P18525 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18525 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18525 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18525 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18525 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18525 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18525 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18525 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18525 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18525 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P18525 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18525 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18525 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18525 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18525 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18525 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18525 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18525 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18525 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18525 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18525 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P18525 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18525 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18525 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18525 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18525 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18525 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18525 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18525 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18525 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P18525 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18525 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18525 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18525 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18525 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18525 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18525 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18525 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18525 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18525 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18525 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18525 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18525 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms