Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb2P0C1T1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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