Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtaP09225 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtaP09225 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtaP09225 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtaP09225 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtaP09225 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtaP09225 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LtaP09225 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtaP09225 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtaP09225 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LtaP09225 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtaP09225 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LtaP09225 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtaP09225 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtaP09225 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtaP09225 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtaP09225 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtaP09225 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtaP09225 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtaP09225 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LtaP09225 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtaP09225 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtaP09225 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtaP09225 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtaP09225 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtaP09225 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtaP09225 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtaP09225 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtaP09225 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtaP09225 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtaP09225 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LtaP09225 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtaP09225 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtaP09225 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtaP09225 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtaP09225 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtaP09225 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtaP09225 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtaP09225 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtaP09225 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtaP09225 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtaP09225 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtaP09225 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LtaP09225 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtaP09225 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtaP09225 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtaP09225 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtaP09225 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtaP09225 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtaP09225 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtaP09225 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtaP09225 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LtaP09225 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtaP09225 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtaP09225 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtaP09225 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LtaP09225 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtaP09225 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtaP09225 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtaP09225 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtaP09225 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtaP09225 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtaP09225 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LtaP09225 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtaP09225 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtaP09225 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtaP09225 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LtaP09225 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtaP09225 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LtaP09225 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LtaP09225 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtaP09225 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtaP09225 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtaP09225 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtaP09225 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtaP09225 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtaP09225 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtaP09225 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtaP09225 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtaP09225 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtaP09225 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtaP09225 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtaP09225 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtaP09225 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtaP09225 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtaP09225 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtaP09225 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtaP09225 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtaP09225 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtaP09225 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtaP09225 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtaP09225 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtaP09225 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtaP09225 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtaP09225 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtaP09225 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtaP09225 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtaP09225 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtaP09225 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtaP09225 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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