Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChadO55226 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChadO55226 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChadO55226 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChadO55226 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChadO55226 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChadO55226 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChadO55226 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChadO55226 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChadO55226 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ChadO55226 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChadO55226 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChadO55226 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChadO55226 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ChadO55226 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChadO55226 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChadO55226 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChadO55226 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChadO55226 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChadO55226 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChadO55226 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChadO55226 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChadO55226 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChadO55226 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChadO55226 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChadO55226 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChadO55226 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChadO55226 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChadO55226 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChadO55226 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChadO55226 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChadO55226 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChadO55226 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChadO55226 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChadO55226 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChadO55226 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChadO55226 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChadO55226 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChadO55226 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChadO55226 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChadO55226 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChadO55226 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChadO55226 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChadO55226 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ChadO55226 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChadO55226 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChadO55226 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChadO55226 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChadO55226 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ChadO55226 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ChadO55226 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChadO55226 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChadO55226 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChadO55226 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChadO55226 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChadO55226 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChadO55226 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChadO55226 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChadO55226 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChadO55226 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChadO55226 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ChadO55226 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChadO55226 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChadO55226 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChadO55226 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChadO55226 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ChadO55226 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChadO55226 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChadO55226 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChadO55226 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChadO55226 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChadO55226 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChadO55226 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChadO55226 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChadO55226 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChadO55226 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChadO55226 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChadO55226 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChadO55226 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChadO55226 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChadO55226 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChadO55226 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChadO55226 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChadO55226 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChadO55226 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChadO55226 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChadO55226 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChadO55226 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChadO55226 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChadO55226 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChadO55226 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChadO55226 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChadO55226 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChadO55226 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChadO55226 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChadO55226 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChadO55226 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChadO55226 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChadO55226 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChadO55226 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms