Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk3O35492 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk3O35492 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk3O35492 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clk3O35492 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clk3O35492 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clk3O35492 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Clk3O35492 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Clk3O35492 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clk3O35492 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clk3O35492 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clk3O35492 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clk3O35492 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clk3O35492 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clk3O35492 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms