Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubgcp6G5E8P0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms