Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms