Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8247F6VRJ8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm8247F6VRJ8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms