Protein–RNA interactions for Protein: E9PVU2

4931429L15Rik, RIKEN cDNA 4931429L15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931429L15RikE9PVU2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4931429L15RikE9PVU2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931429L15RikE9PVU2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms