Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc62E9PVD1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms