Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1V9

Defa28, Defensin, alpha, 28, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa28D3Z1V9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Defa28D3Z1V9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa28D3Z1V9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms