Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms