Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd8B9EJ80 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms