Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms