Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Grik3B1AS29 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik3B1AS29 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms