Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef25A2ASI9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef25A2ASI9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms