Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syndig1A2ANU3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms