Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B694

Trav14-2, T cell receptor alpha variable 14-2 (Fragment), mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav14-2A0A075B694 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Trav14-2A0A075B694 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Trav14-2A0A075B694 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Trav14-2A0A075B694 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Trav14-2A0A075B694 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Trav14-2A0A075B694 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trav14-2A0A075B694 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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