Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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