Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Ctnna3Q65CL1 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Ctnna3Q65CL1 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ctnna3Q65CL1 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ctnna3Q65CL1 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ctnna3Q65CL1 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ctnna3Q65CL1 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ctnna3Q65CL1 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Ctnna3Q65CL1 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctnna3Q65CL1 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctnna3Q65CL1 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctnna3Q65CL1 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctnna3Q65CL1 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctnna3Q65CL1 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctnna3Q65CL1 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctnna3Q65CL1 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctnna3Q65CL1 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctnna3Q65CL1 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctnna3Q65CL1 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctnna3Q65CL1 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctnna3Q65CL1 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctnna3Q65CL1 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctnna3Q65CL1 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctnna3Q65CL1 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctnna3Q65CL1 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctnna3Q65CL1 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctnna3Q65CL1 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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