Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

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Length 382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Acsl6-207ENSMUST00000101213 2730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Lrit3-202ENSMUST00000185462 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Nanog-203ENSMUST00000112581 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Zfp94-202ENSMUST00000108436 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Atxn3-201ENSMUST00000021606 5363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Crxos-204ENSMUST00000150050 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Atp2c1-216ENSMUST00000177074 2664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm9978-201ENSMUST00000069431 3273 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm28427-201ENSMUST00000190144 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm38072-201ENSMUST00000192127 2162 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Mast2-202ENSMUST00000106484 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Mfsd2b-204ENSMUST00000137337 2641 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Wdhd1-202ENSMUST00000111792 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Kif3a-203ENSMUST00000120613 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Prcp-202ENSMUST00000207594 2245 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gpr68-202ENSMUST00000110065 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Scn2b-202ENSMUST00000170998 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 2610028H24Rik-201ENSMUST00000092406 1640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm24284-201ENSMUST00000104240 142 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm16008-201ENSMUST00000126009 810 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm26040-201ENSMUST00000158147 161 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm5313-201ENSMUST00000182893 987 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm27197-201ENSMUST00000184325 479 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm28477-201ENSMUST00000188125 406 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm28728-201ENSMUST00000189087 405 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Kcnk2-208ENSMUST00000194172 1200 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm8115-201ENSMUST00000197137 736 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm45619-201ENSMUST00000210360 528 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm40538-201ENSMUST00000220610 578 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 AC211878.7-201ENSMUST00000222851 661 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm21541-201ENSMUST00000098128 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Cd200-201ENSMUST00000023341 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm28758-201ENSMUST00000186123 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm29226-201ENSMUST00000186871 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm28824-201ENSMUST00000187496 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm28948-201ENSMUST00000188447 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm29472-201ENSMUST00000188599 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm28977-201ENSMUST00000188678 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Hivep2-205ENSMUST00000191138 9846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm13140-201ENSMUST00000119840 3151 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Baiap3-204ENSMUST00000182435 3758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Rsf1-201ENSMUST00000107153 11124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Herc3-202ENSMUST00000041401 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Zfp958-201ENSMUST00000073201 1401 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Epb41l3-215ENSMUST00000225977 3188 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Pcdh18-202ENSMUST00000191794 5146 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Mcmdc2-201ENSMUST00000052843 2826 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Sh3rf1-202ENSMUST00000209611 4416 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Crb1-201ENSMUST00000059825 5901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 L3mbtl3-201ENSMUST00000040219 4572 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm15666-201ENSMUST00000118054 976 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.2 ms