Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Ggta1P23336 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Ggta1P23336 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Ggta1P23336 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Ggta1P23336 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Ggta1P23336 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Ggta1P23336 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Ggta1P23336 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ggta1P23336 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Ggta1P23336 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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Ggta1P23336 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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Ggta1P23336 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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Ggta1P23336 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms