Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV92

Epb41l3, Band 4.1-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l3Q9WV92 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Epb41l3Q9WV92 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epb41l3Q9WV92 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms