Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms