Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A4Q9NY91 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms