Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap3m1Q9JKC8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap3m1Q9JKC8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap3m1Q9JKC8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap3m1Q9JKC8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap3m1Q9JKC8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap3m1Q9JKC8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap3m1Q9JKC8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap3m1Q9JKC8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap3m1Q9JKC8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap3m1Q9JKC8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap3m1Q9JKC8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap3m1Q9JKC8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap3m1Q9JKC8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap3m1Q9JKC8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms