Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nrip3Q9JJR9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrip3Q9JJR9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms