Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8M3

Slc48a1, Heme transporter HRG1, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc48a1Q9D8M3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc48a1Q9D8M3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc48a1Q9D8M3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc48a1Q9D8M3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc48a1Q9D8M3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc48a1Q9D8M3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc48a1Q9D8M3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc48a1Q9D8M3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc48a1Q9D8M3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc48a1Q9D8M3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc48a1Q9D8M3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc48a1Q9D8M3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc48a1Q9D8M3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc48a1Q9D8M3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc48a1Q9D8M3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc48a1Q9D8M3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc48a1Q9D8M3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms