Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh4Q9D8F1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms