Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spsb1Q9D5L7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spsb1Q9D5L7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spsb1Q9D5L7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spsb1Q9D5L7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spsb1Q9D5L7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms