Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf6Q9D4J7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf6Q9D4J7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms