Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx7Q9CY18 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms