Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms