Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms