Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CQF4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CQF4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CQF4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CQF4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQF4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQF4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CQF4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CQF4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CQF4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CQF4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CQF4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQF4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQF4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQF4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQF4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQF4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQF4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQF4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQF4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQF4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQF4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQF4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQF4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQF4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQF4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQF4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQF4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CQF4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CQF4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CQF4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CQF4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9CQF4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms