Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pole4Q9CQ36 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pole4Q9CQ36 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pole4Q9CQ36 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pole4Q9CQ36 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pole4Q9CQ36 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pole4Q9CQ36 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms