Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms