Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cstf3Q99LI7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms