Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cts3Q91ZD5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms