Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lrrc49Q91YK0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms