Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d2Q8VD57 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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