Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W2

0610009B22Rik, MCG6979, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610009B22RikQ8R3W2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
0610009B22RikQ8R3W2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms