Protein–RNA interactions for Protein: Q8K199

Cmc2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc2Q8K199 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Cmc2Q8K199 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Cmc2Q8K199 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Cmc2Q8K199 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Cmc2Q8K199 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Cmc2Q8K199 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Cmc2Q8K199 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Cmc2Q8K199 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmc2Q8K199 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cmc2Q8K199 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms