Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rnf170Q8CBG9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf170Q8CBG9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf170Q8CBG9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf170Q8CBG9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf170Q8CBG9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf170Q8CBG9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf170Q8CBG9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf170Q8CBG9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf170Q8CBG9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf170Q8CBG9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf170Q8CBG9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf170Q8CBG9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rnf170Q8CBG9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf170Q8CBG9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rnf170Q8CBG9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf170Q8CBG9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf170Q8CBG9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf170Q8CBG9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf170Q8CBG9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf170Q8CBG9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf170Q8CBG9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rnf170Q8CBG9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf170Q8CBG9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rnf170Q8CBG9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rnf170Q8CBG9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rnf170Q8CBG9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rnf170Q8CBG9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rnf170Q8CBG9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf170Q8CBG9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf170Q8CBG9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf170Q8CBG9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf170Q8CBG9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf170Q8CBG9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf170Q8CBG9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf170Q8CBG9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf170Q8CBG9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf170Q8CBG9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf170Q8CBG9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf170Q8CBG9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf170Q8CBG9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Rnf170Q8CBG9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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