Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXF8

Actrt3, Actin-related protein T3, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt3Q8BXF8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Actrt3Q8BXF8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actrt3Q8BXF8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms