Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40Q8BWR4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp40Q8BWR4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp40Q8BWR4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
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