Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSA9

Tyw3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tyw3Q8BSA9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tyw3Q8BSA9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms