Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc27Q80YS5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Lrrc27Q80YS5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
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Lrrc27Q80YS5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc27Q80YS5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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